Eu encontrei um problema parecido. O meu foi:
CHKDSK is verifying files (stage 1 of 3)...
394752 file records processed.
File verification completed.
12 large file records processed.
0 bad file records processed.
0 EA records processed.
0 reparse records processed.
CHKDSK is verifying indexes (stage 2 of 3)...
67 percent complete. (430369 of 498700 index entries processed)
An unspecified error occurred (696e647863686b2e e19).
Eu pesquisei na web inteira e não achei nada útil. Então comecei a verificar a unidade manualmente. Índices são diretórios em NTFS, então comecei a verificar seu conteúdo. Eu descobri backup antigo que tem arquivos com caracteres russos em nomes. Aplicativos não unicode (como console e Altap Salamander) não podem mostrar os caracteres e exibir apenas '?' em vez de. O aplicativo pronto para Unicode (como o Total Commander) mostra um aviso quando você insere um diretório com arquivos como esses. Então, eu apenas executo o Windows Explorer e simplesmente excluo esse backup antigo com nomes de arquivo de caracteres não ingleses.
Depois, o chkdsk é executado normalmente. Talvez isso ajude alguém.
CHKDSK is verifying files (stage 1 of 3)...
394752 file records processed.
File verification completed.
12 large file records processed.
0 bad file records processed.
0 EA records processed.
0 reparse records processed.
CHKDSK is verifying indexes (stage 2 of 3)...
496480 index entries processed.
Index verification completed.
0 unindexed files scanned.
0 unindexed files recovered.
CHKDSK is verifying security descriptors (stage 3 of 3)...
394752 file SDs/SIDs processed.
Security descriptor verification completed.
50865 data files processed.
CHKDSK is verifying Usn Journal...
541649592 USN bytes processed.
Usn Journal verification completed.
Windows has checked the file system and found no problems.