Você pode definir uma pasta adicional de preenchimento automático que pode ter suas definições personalizadas nela. Se você tem algo parecido com o padrão .zshrc, basta atualizar o $ fpath antes de chamar autoload -Uz compinit .
Exemplo:
...
zstyle ':completion:*' use-compctl true
zstyle ':completion:*' verbose true
zstyle :compinstall filename "$HOME/.zshrc"
fpath=($HOME/autocomplete $fpath)
autoload -Uz compinit
compinit
# End of lines added by compinstall
...
Deverá então poder copiar o seu _git atualizado para a sua pasta pessoal de preenchimento automático e será utilizado no lugar do original.