Eu tenho uma relação de amor / ódio com o Ubuntu dual-boot no Windows. O primeiro Ubuntu que eu instalei foi 9.04. Eu instalei o Windows XP na época. Naquela primeira vez foi uma doce descoberta do que se pode fazer com o dual-boot. Deixe-me compartilhar minhas experiências com os modos sugeridos aqui.
Instalando o Ubuntu dentro do Windows via Wubi. Esta é a melhor escolha se o que você quer fazer é ter uma idéia do Ubuntu primeiro. Mas o Wubi permite apenas um armazenamento de 30Gb dentro do Windows. Como novato no Ubuntu e Linux na época, eu estava acostumado a ver um relatório gráfico do meu uso de disco no Windows. Eu nunca tive esse feedback no começo com o Ubuntu. Houve um dia em que não consegui mais entrar no Ubuntu. Depois de pesquisar sobre o meu problema, descobri que eu poderia ter excedido minha capacidade de armazenamento de 30 Gb Wubi. Além disso, você não pode usar a capacidade total do seu computador se você acabou de rodar o Ubuntu dentro do Windows. Este último motivo foi o motivo que me fez decidir instalar o Ubuntu diretamente no meu disco rígido.
Instalando o Ubuntu ao lado do Windows com um HDD. Isso é muito bom, já que você pode alternar facilmente entre o Ubuntu e o Windows usando apenas um computador. Gamers, usuários de softwares que não têm um equivalente de código-fonte aberto satisfatório no Linux e pessoas que trabalham com o Windows em seus escritórios fazem isso. Eu costumava fazer isso também. Houve um tempo, no entanto, que eu errei durante a instalação de uma atualização (de 9.10 para 10.04). Eu não conseguia mais acessar meus arquivos do Ubuntu e não sabia nada sobre o assunto, então acabei fazendo backup dos arquivos do Windows e reinstalando o Windows e o Ubuntu novamente, pois não queria acabar sendo incapaz de usar a outra metade do meu disco rígido. Isso foi de fato alguma experiência de aprendizado, uma que eu não recomendaria especialmente se você quiser manter um emprego diário.
Instalando o Ubuntu em outro disco rígido. É por isso que concordo totalmente com o wolfo9999 neste. O hardware não sai barato, mas pelo menos você não se incomodará em mexer todo o seu trabalho no outro disco apenas por causa de um bug ou erro que tenha aparecido em algum lugar durante a instalação.