As janelas estão posicionadas de alguma posição inicial (por exemplo, perto do canto superior esquerdo) e todas as janelas subseqüentes são posicionadas ligeiramente para a direita.
Esse modo de posicionamento é codificado em aplicativos (ou, mais provavelmente, nas estruturas Apple que esses aplicativos usam). Você precisaria modificar a própria visualização. Não há preferência por isso: As preferências Just Jake menciona não estão relacionadas a janelas do visualizador de documentos, mas a todas as janelas que existem apenas uma vez (selecionador de cores, preferências, etc.).
Infelizmente, o Preview não é mais o AppleScriptable, então não acho possível escrever um AppleScript que mova a janela.
Dê uma olhada no software de manipulação de janelas de terceiros, como SizeUp and Cinch ou MercuryMover .