Eu não acho que você pode redirecionar esses conectores usando software, ou simplesmente fazendo alterações nas opções do driver. Tudo isso é bem baixo nível.
A única solução que consigo ver funcionando seria (de alguma forma) conectar o conector "mic-in" frontal a cabeçalhos diferentes na placa-mãe (aqueles que correspondiam ao conector de headphone frontal).
Deve ser bem fácil de fazer: