O Windows XP e versões posteriores (Vista, 7) são baseados no kernel do Windows NT e não dependem do DOS, ao contrário do Windows 3.1, 3.11, 95, 98 e ME. O Windows Me derrubou o suporte a DOS de modo real.
O Windows NT inclui um NTVDM (NT Virtual DOS Machine) que emula um modo DOS de 16 bits para versões de 32 bits, mas não de 64 bits.
Se você realmente precisa executar ferramentas que dependem de chamadas de interface de hardware e BIOS de baixo nível no modo de 16 bits, é necessário inicializar em um ambiente DOS totalmente fora do Windows.
FreeDOS um exemplo de um ambiente DOS separado em modo real de 16 bits. Você pode instalá-lo em uma partição separada, executá-lo a partir de um CD ao vivo ou de um pendrive.