O terminal tem controles para espaçamento horizontal e vertical no painel Fonte, que você pode abrir clicando no botão Alterar:
Terminal > Preferências > Configurações > [sua configuração] > Texto > Fonte > Alterar
Além disso, se você usar os caracteres "gráficos" do VT100, o Terminal os renderizará desenhando as linhas "manualmente" para garantir que elas se conectem, em vez de usar glifos de caracteres. Infelizmente, não contém caixas de células de caracteres únicos. Você teria que desenhar caixas usando quatro personagens para desenhar os cantos. por exemplo:
tput smacs; echo 'lk'; echo 'mj'; tput rmacs
Usar um caractere de espaço com uma cor de plano de fundo, como sugerido por Miles, é a melhor maneira de preencher exatamente uma célula de caractere.