Normalmente, você reconstruiria o arquivo boot.ini usando o comando bootcfg / rebuild a partir do prompt de comando, a fim de ter acesso a ambas as instâncias do Windows XP a partir do menu de inicialização.
Como você quer executar ambas as instâncias do mesmo disco, para aparecer como "C:", você pode encontrar problemas usando o comando acima. Talvez não, nesse caso, o comando acima é tudo que você precisa fazer!
Se você tiver problemas com isso, eu editaria manualmente o arquivo boot.ini
na sua primeira instalação (mestre) do Windows XP para algo assim:
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\Windows
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(2)\Windows
A diferença importante é o número da partição. Consulte o artigo da Microsoft KB chamado BOOT.INI e convenções de nomenclatura de caminho ARC e uso para informações básicas informações sobre isso.