Acho que o seu maior problema aqui é que o PC não inicializa a partir do USB. Este é um recurso relativamente novo do BIOS.
Em caso afirmativo, eu pessoalmente recomendaria usar uma versão Live como o Knoppix para esse propósito em vez de tentar tratar a unidade USB como outra dirigir. O mais tardar é improvável que seja bem sucedido e, mesmo que seja, é provável que seja muito lento. Também colocaria muito desgaste na unidade.
Uma versão ao vivo com persistência funcionará muito bem para o que você quer e pode ser facilmente trocada para outro PC a qualquer momento.
No entanto, você precisa verificar se consegue inicializar a partir do USB primeiro.
ATUALIZAÇÃO: Hmm, comentários interessantes do link fornecido. A segurança é certamente válida, mas a velocidade presume que você irá ajustar a instalação para ser otimizada para seu uso. Você vai fazer isso?
Além disso, não estou convencido de que seria mais rápido quando rodando já que qualquer distro assumirá que está rodando a partir de um disco rígido e não de um drive USB2 e assim fará um bom uso do disco velocidades disponíveis a partir da unidade (pense em registrar, por exemplo). É isso que coloca o desgaste no cartão de memória. Lembre-se que os cartões de memória são especificamente não projetados para esse tipo de uso. Eles são feitos o mais barato possível com a expectativa de que eles serão usados principalmente para armazenar imagens, e não como o padrão de leitura / gravação constante associado ao uso do sistema operacional. Os cartões de memória podem falhar muito rapidamente quando usados incorretamente.
Por outro lado, as distribuições Live são especificamente feitas para esse tipo de uso. Carregando o máximo possível na memória e evitando a mídia de origem, se possível. Isso será mais rápido e causará menos desgaste no dispositivo.