Da perspectiva de um desenvolvedor, não. Quando você usa o DWM, aproveita a área de trabalho compostada, o que significa que as janelas de aplicativos não precisam repintar muito, o que traz certos benefícios de desempenho.
No Windows XP muitas operações GDI / GDI + são aceleradas por hardware, como BitBlt, preenchimento de formas, texto de desenho, etc. - no entanto, o Windows Vista removeu mais aceleração, o Windows 7 trouxe alguma aceleração de volta, mas não tanto quanto o XP no entanto, essa configuração é (não acredito) controlada pelo painel de controle do sistema.
O desenvolvedor e blogueiro de Deus Raymond Chen escreveu um bom artigo sobre essa configuração, na verdade, e como ela é amplamente irrelevante hoje em dia: link