Não tenho certeza do que você quer dizer com "apagar o histórico do Prompt de Comando". Quer dizer que você está lançando jogos do comando Executar e seu irmão consegue ver os comandos que você digitou pressionando a seta para baixo após abrir a janela Executar? Se assim for, encontrei um artigo dizendo que você pode tentar fazer o seguinte :
- Open the Run Window
- reg delete HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\RunMRU /va /f
- Log out and log back in
Se você está falando sobre o Prompt de Comando , tudo o que você precisa fazer é fechar a janela do prompt de comando depois de terminar de jogar seu jogo. Tanto quanto sei, não há histórico de comandos salvos que você digitou no Prompt de Comando que seria salvo em algum lugar como está no ambiente * NIX.
Como um aparte, eu concordo com o que o Chris mencionou, sobre sentar seu irmão e explicar por que você não quer que ele jogue este jogo.