Todos eles.
Ou pelo menos qualquer um que possa ser convertido em HTML, que provavelmente é todos eles. Para converter em HTML, consulte o que o Github suporta :
- .markdown
- .textile
- .rdoc (documentação do Ruby)
- .org (modo de organização)
- .creole
- .mediawiki
- .rst (documentação do Python)
- .asciidoc
- .pod
O programa conversor do Github chama várias bibliotecas Ruby para fazer a conversão.
De HTML, você pode converter para OOXML usando Pandoc, ou apenas abrir o HTML no MS Word.