Eu fui para Configurações > Aparência > Fontes > Renderização
alterou ordem de sub-pixels para: Nenhuma
Isso resolveu o problema para mim.
Acabei de instalar o Xubuntu 14.04 como uma inicialização dupla em um desktop (CPU Pentium R4, 2.66 GHZ, 2G RAM) rodando a edição home do XP. Em algumas situações, quando no Xubuntu estou tendo o que parece ser problemas de atualização de tela.
Os ícones aparecem bem no menu que aparece quando clico com o botão direito na área de trabalho e no menu que aparece quando clico no ícone do mouse no canto superior esquerdo.
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alterou ordem de sub-pixels para: Nenhuma
Isso resolveu o problema para mim.
Talvez tenha sido a memória compartilhada com o RAM de vídeo. Dê uma olhada no /etc/X11/xorg.conf (em 16.04 é um diretório /usr/share/X11/xorg.conf.d/). Em "Section 'Device'" pesquise por "VideoRam" e altere o número de uma informação correta do seu RAM compartilhado com seu vídeo onboard.
Section "Device"
Identifier "Generic Video Card"
VendorName "Silicon Integrated Systems [SiS]"
BoardName "771/671 PCIE VGA Display Adapter"
Busid "PCI:1:0:0"
Driver "vesa"
Screen 0
Option "UseFBDev" "true"
Option "DPMS"
Option "ShadowFB"
Option "MaxXFBMem"
VideoRam 128000
Option "RenderAccel" "true"
Option "AllowGLXWithComposite" "true"
Option "backingstore" "true"
Option "AddARGBGLXVisuals" "True"
Se "VideoRam" não existir, tente criar.