Você não precisa instalar o software para acessar os vídeos em uma câmera Flip. Se você procurar na pasta / DCIM (no Mac Finder ou no Windows Explorer), poderá ver cada um dos vídeos armazenados como arquivos .MP4. Você pode copiar os arquivos como quiser e reproduzi-los em qualquer programa que reproduza filmes em MP3.
Tenha cuidado se você copiar manualmente os arquivos. O software flip usa o carimbo de data do arquivo para determinar a data do filme. Se você copiar o filme para outro local, o carimbo de data será atualizado para o horário atual e não haverá registro permanente do horário em que o vídeo foi originalmente gravado.
Portanto, para responder à sua pergunta: você não precisa depender do software Flip, e os arquivos .MP4 são armazenados em um formato MPEG padrão que não deve ser excessivamente propenso a obsolescência. Não se preocupe com o formato do arquivo, a menos que você tenha um motivo para desejá-lo em outro formato.