Isso aconteceu comigo quando baixei o Mountain Lion. Incluiu o Mail 6.2. Todas as minhas outras pastas, exceto as caixas de entrada, desapareceram. O email enviado desde o download está aparecendo.
No Apple Mail, criei uma Caixa de Correio Inteligente e defini as regras como "De" Contém: "meu endereço de e-mail" e, em seguida, nomeei a caixa de correio "Enviada". Além disso, cliquei para incluir todos os e-mails que estão em "Enviados".
No Gmail, rotulei todos os e-mails "Enviados" para receberem um rótulo adicional com o "E-mail enviado". A pasta IMAP foi criada automaticamente. (Não sei quando)
Quando voltei para minha caixa de correio de e-mail inteligente chamada "Enviada", enviei todos os e-mails meus de lá.
Quando eu chequei a caixa "Enviado", eu tinha segmentos completos de e-mails que eram enviados.