TrueCrypt pode fazer isso. Você desejará criptografar toda a unidade como visto na segunda opção aqui "Criptografar uma partição / unidade sem sistema" :
Estava se perguntando se existe uma maneira de proteger o conteúdo de um disco rígido externo?
É possível fazer a senha de um disco rígido externo, de modo que, quando conectado a um sistema, seja necessária uma senha para acessá-lo?
DiskCryptor - solução de criptografia de partições de código aberto
DiskCryptor is the only truly free solution, provided under GNU General Public License (GPLv3), which offers encryption of all disk partitions, including the system partition. The main criteria for open-source software is the availability of its source code under one of the open source licenses. The only open-source alternative to DiskCryptor that has comparable features is TrueCrypt. However, because of the restrictive license under which TrueCrypt is provided - the TrueCrypt Collective License - TrueCrypt cannot be classified as a truly free software, as it places limits on the use and modification of its source code by developers. There are other alternatives with similar functionality, but they are fully proprietary ones, which makes them unacceptable to use for protection of confidential data.
como em todas as unidades criptografadas (e especialmente unidades portáteis), você deve manter um backup dos seus arquivos em um local seguro (possivelmente não criptografado)!
Isso pode ser melhor em SuperUser ou ServerFault. Diretamente não sei de nenhuma maneira de fazer isso, talvez seja melhor saber em que O / S você está tentando realizar isso. Você poderia usar TrueCrypt ou algo semelhante para criptografar o disco no nível de volume. No entanto, com TrueCrypt ele não solicitaria a senha necessariamente, ele apenas mostraria a unidade como cheia de ruído branco (isto é, sem formatação), você precisaria saber para carregar o driver para montar o volume e fornecer a senha apropriada.
Também deve ser notado que o TrueCrypt (e o BitLocker também) mostraram ter uma falha que permite a alguém interceptar o carregamento do driver seguro e antecipar a rotina de verificação de senha, dando-lhe acesso à senha. Esse ataque não é trivial e requer acesso físico ao dispositivo. Você pode ler sobre o ataque Maid Maid aqui.
Se você estiver usando o Linux, LUKS está incluído na maioria das distribuições Linux atualmente. Você pode usar o LUKS para criptografar um disco rígido externo, um pendrive USB e também o nome dele.
Se você está preocupado em precisar de acesso do Windows, pode usar o FreeOTFE para acessar as unidades criptografadas do LUKS.
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