Basta criar tarefas com o seguinte comando:
cmd.exe -new_console:aA
Versão reprovada antiga usando psexec:
-new_console:abn C:\Tools\PsTools\psexec.exe -s -h -d -i "%ConEmuBaseDir%\ConEmuC64.exe" /ATTACH /GHWND=%ConEmuHWND% /ADMIN /ROOT cmd.exe