Seu perfil bash pode ser acessado pelo Windows 10 por caminho:
%USERPROFILE%\AppData\Local\lxss\home\[bash-username]
Você deve colocar seu par de chaves SSH em
%USERPROFILE%\AppData\Local\lxss\home\[bash-username]\.ssh
E não se esqueça das permissões no id_rsa. deve ser definido para 600, executando (no bash)
cd ~/.ssh ; chmod 600 id_rsa