você pode usar um bash para loop com um passo (se for bash v4)
então seria
#!/usr/bin/bash
cd /path/to/directory/
for i in 'ls *{0..100..2}'
do
rm $i
done
isso pode ser colocado no seu crontab para ser executado toda semana / mês
00 11 1 * * /path/to/script.sh executará no primeiro dia do mês às 11h
00 11 * * 1 /path/to/script.sh executará todas as segundas-feiras