Se eu entendi a pergunta corretamente (estou acostumado com o Emacs, mas não com os aquamacs), seus "painéis" são chamados de "janelas" na terminologia padrão do Emacs.
Com as vinculações de teclas padrão, você pode usar C-x o (vinculado a other-window ) para alternar entre as janelas.
Também há muitas extensões que permitem gerenciar janelas. Um deles é windmove , que permite alternar entre janelas usando S-<arrows> atalhos de teclado.