Algo assim é um começo bem difícil.
osascript -e 'tell application "Finder"' -e 'set visible of process "Twitter" to false' -e 'end tell'
Aqui está um exemplo um pouco melhor
on run argv
set programName to item 1 of argv
tell application "Finder"
set visible of process programName to false
end tell
end run
Que você executa com osascript ~/hider.scpt Twitter
como exemplo, supondo que esteja em seu diretório home com o nome hider.scpt e deseja ocultar o Twitter.app (você não usa a palavra '.app').