Se o teclado está funcionando bem, e é apenas a luz de fundo que pisca, então deve estar perfeitamente bem.
Mesmo que o teclado esteja perdendo energia intermitentemente, não é grande coisa, pois o USB foi projetado para ser conectado a quente.
No entanto, existe a mentalidade "melhor prevenir do que remediar". O custo de substituir seu teclado vale mais do que o risco de danificar sua placa-mãe? Isso é uma decisão pessoal. Minha opinião é que deveria estar bem.