Esse "caractere de nova linha" é parte do prompt do Bash , mantido na variável $PS1
:
PS1='\[\e]0;\w\a\]\n\[\e[32m\]\u@\h \[\e[33m\]\w\[\e[0m\] \$ '
Remova-o e coloque o PS1 atualizado no seu ~/.bashrc
.
Consulte Personalizando o prompt do bash para obter mais informações.