Um arquivo que não está sendo reproduzido pode ser devido a informações erradas no próprio arquivo. Observar o conteúdo com MediaInfo pode revelar alguns problemas.
Pode haver um problema comum com outros arquivos MKV no mesmo diretório. Se você já tentou as etapas da FAQ do VLC e ainda não funciona, pode ser um problema de codec.
Você também deve tentar instalar os K-Lite Codecs . Eles adicionam suporte para muitos tipos de arquivos e codecs de vídeo ao Windows.