A explicação que você ouviu é altamente suspeita. Ao instalar um sistema operacional alternativo pode (se você não tiver cuidado) colocar a tabela de partições no seu disco rígido, eu altamente duvido que você acidentalmente sobrecarregue a CPU com tanta força que ela quebre.
Existem problemas com o gerenciamento de energia (ou falta deles) rodando a CPU muito quente e não rodando os ventiladores a toda velocidade, mas isso não deve arruinar a máquina.