Seu ganho de desempenho ao fazer um desses é tão minúsculo que não vale a pena. Se você tem uma máquina pré-10.6 você pode economizar um pouco de memória RAM não tendo muitos itens na sua área de trabalho.
Se você insistir, pode adicionar uma opção de saída ao Finder com:
defaults write com.apple.Finder QuitMenuItem -bool YES
Você precisa reiniciar para que o Quit apareça e você não verá o que está na área de trabalho depois de sair do Finder.
Seu comando para holofotes está correto para a inicialização, mas você também pode especificar outras unidades no lugar de /. Você pode descobrir que Spotless encerra mais processos, e é ótimo se você estiver conectando muitas unidades e não quero que eles sejam indexados automaticamente.