Você pode inicializar a partir de um Live CD do Ubuntu e editar o arquivo C: \ boot.ini, basta abri-lo no bloco de notas e este é um exemplo de sua estrutura:
[boot loader]
timeout=5
default=multi(0)disk(0)rdisk(1)partition(1)\WINDOWS
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(1)partition(1)\WINDOWS="Microsoft Windows XP Home Edition" /fastdetect