Um ou dois setores defeituosos no arquivo não degradarão o arquivo, supondo que você possa obtê-lo do DVD em primeiro lugar.
Devido à maneira como o processo de codificação / decodificação de vídeo funciona, eu esperaria que houvesse (na pior das hipóteses) um segundo ou dois em que a imagem parecesse "estranha" após os dados ruins, mas depois disso o vídeo deveria se recuperar e continuar brincar.
Como você afirmou, os dados-chave são o cabeçalho, desde que esses dados estejam intactos (junto com a maioria do arquivo), então o arquivo deve ser jogável.
O software DVD Decrypter é capaz de ignorar erros e continuar copiando dados de um disco, mas seu uso é de legalidade duvidosa. Se este é seu próprio DVD feito pessoalmente, então você deve estar bem.
As DVD Decrypter facilitates the removal of copy restrictions, certain uses may be illegal under the United States Digital Millennium Copyright Act unless making copies which are covered under the Fair Use doctrine. In countries without similar laws there may not be any legal restrictions.