O GPT é muito mais resistente à corrupção de dados por causa do CRC e porque armazena várias cópias dos dados de particionamento e de inicialização, Assim, a recuperação ainda é possível após uma falha catastrófica de dados.
Além disso, o GPT tem um "MBR protetor", de modo que o disco GPT ainda se parece com o MBR para um software mais antigo. Como o seu disco é de 1 TB, e como o MBR pode suportar até 2 TB, mesmo formatado como GPT, o disco inteiro será utilizável como MBR e GPT.
Portanto, você pode usar qualquer formato, exceto que a GPT pode conservar melhor seus dados.