xwininfo (basta iniciá-lo e clicar na janela com o ícone de cruz que aparece) pode dizer-lhe alguns detalhes dessa janela e xkill pode se livrar dele. Infelizmente, o sistema de script de início de qualquer gerenciador de janelas é uma pilha de espaguete e sempre que as tentativas de simplificação são feitas é ainda mais spaghettified para que eu não me atrevo a dar dicas sem ver. Depois de ter informações sobre a janela, você pode ter alguma pista sobre o que procurar.