Há duas coisas que notei:
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A pequena figura sentada em cima do estojo pode estar causando vibrações.
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Com o PC sentado no chão, pode ser necessária uma boa limpeza. É possível que o ventilador tenha sujeira colada nas lâminas. Isso pode causar desequilíbrio no ventilador, causando vibração e falha prematura do rolamento.
Eu sei que você disse que você limpou, mas deve prestar atenção especial ao (s) ventilador (es) e usar um pincel pequeno para soltar uma sujeira endurecida das lâminas. Se isso foi feito e o som ainda é um problema, substitua o ventilador. De qualquer forma, a limpeza não vai doer.