Você não precisa criar o movimento de sobreposição como uma etapa separada.
Primeiro crie a sobreposição como um filme desta forma:
-loop 1 -i watermark.png
Em seguida, use um filtro de atenuação para aparecer por 4 segundos (ou seja, 100 quadros):
fade=in:0:100
Em seguida, adie por 10 segundos para começar mais tarde desta forma:
setpts=PTS-STARTPTS+10/TB
Seu comando então se torna:
ffmpeg -i video.mp4 -loop 1 -i watermark.png -filter_complex \
"[1:v]fade=in:0:100[v1]; [0:v]setpts=PTS-STARTPTS[v0]; \
[v1]setpts=PTS-STARTPTS+10/TB[v3];[v0][v3]overlay=eof_action=pass[out1]" \
-map [out1] <other parameters> overlaidoutput.mp4
A sobreposição continuará até o final. E, claro, você pode usar muitos parâmetros de ajuste fino na seção " outros parâmetros ".
NOTA: usei 100 quadros por 4 segundos porque usei 25 fps PAL. Você pode mudar isso para 120 frames se trabalhar em 30 fps.
Se você precisar encerrar a sobreposição em um ponto de tempo específico, também poderá usar o parâmetro enable
:
ffmpeg -i video.mp4 -loop 1 -i watermark.png -filter_complex \
"[1:v]fade=in:0:100[v1]; [0:v]setpts=PTS-STARTPTS[v0]; \
[v1]setpts=PTS-STARTPTS+10/TB[v3]; \
[v0][v3]overlay=enable='between(t,10,12)':eof_action=pass[out1]" \
-map [out1] <other parameters> overlaidoutput.mp4
Isso termina a sobreposição em 12 segundos. Certifique-se de estar usando o ffmpeg ver 2 ou superior.