Você pode abrir o Gerenciador de Tarefas e remover um núcleo da tela Afinidade do processador.
Ele efetivamente impedirá que o aplicativo use todos os núcleos do seu processador
Se ele funciona fora da estação de trabalho sem problemas, então esse segundo computador é mais poderoso? Sua estação de trabalho tem outras coisas funcionando? Como você confirmou que este software está realmente causando o problema? A estação de trabalho está infectada com um vírus?
Se você está realmente se sentindo corajoso, então você pode olhar para a definição de prioridades e outras coisas, mas isso pode estragar tudo em seu sistema.