A maneira mais fácil de mover uma partição menor para uma unidade maior é clonar a unidade como você já fez, depois abrir a unidade em um utilitário de gerenciamento de partição e redimensionar a partição para usar os 16 GB completos.
Se você estiver usando o Windows, o Disk Manager pode fazer isso | Se você estiver executando o Mac, o Utilitário de Disco pode fazer isso. Se você estiver executando o Linux, use o GParted