Eu também tive esse problema. Eu não tenho mais desde que eu instalei o Ubuntu Gnome 16.04.
O seguinte resolveu para outra pessoa , então você pode querer tentar:
Adicione o seguinte
__GL_YIELD="USLEEP"
KWIN_TRIPLE_BUFFER=0
KWIN_USE_BUFFER_AGE=0
para /etc/environment
.