Pode ser feito facilmente com o PowerShell, JScript ou VBScript. Mas se você quiser ficar no mundo dos lotes, precisará de algum tipo de utilitário não padrão ou programa em lote complicado.
Usando um utilitário JScript / batch híbrido chamado REPL.BAT que executa uma pesquisa em regex e substitui stdin e grava o resultado para stdout:
type "file.txt"|repl "(.*\n){66}" "$&\x0C" mx >"file.txt.new"
move /y "file.txt.new" "file.txt" >nul
O acima pressupõe que você tenha o REPL.BAT no seu diretório atual, ou melhor ainda, em algum lugar dentro do seu caminho.