Você precisa de um arquivo da área de trabalho para colocar algo no inicializador.
gksudo gedit /usr/share/applications/name.desktop
Preencha este modelo:
[Desktop Entry] Name=the name you want shown Comment= Exec=command to run Icon=icon name Terminal=false Type=Application StartupNotify=true
Então você precisa aprender sobre xdotool que pode simular mouse e teclado com comandos.
Espero que isso ajude, mesmo que eu não tenha sido minucioso.