Você precisa corrigir os problemas principais. Natty ainda não foi lançado e apenas os testadores e os corajosos devem estar experimentando (embora eu tenha certeza que muitas pessoas do núcleo do Ubuntu já estão rodando) ele vai ter bugs. Se você quer um sistema estável, você deve reinstalar o Ubuntu e ir para o Lucid ou o Maverick.
Agora, para o problema real mostrado. Parece que a hora da data está em duas linhas, simplesmente porque tem espaço suficiente para isso. A barra superior é maior do que deveria ser e você pode ver isso a partir dos outros ícones que também cresceram para ocupar mais espaço.
Se você entrar no sistema > Preferências > Aparência, em seguida, você pode ver as opções para alterar o tamanho da fonte e tamanhos de ícones que podem ter esse efeito na sua barra superior.