Nunca tentei pessoalmente, mas tenho certeza de que 99,99% você não poderá mover o diretório do Windows com um link de junção.
Isso ocorre porque muitos desses arquivos, incluindo o próprio kernel, são necessários na inicialização, antes que o driver do sistema de arquivos seja carregado.
Também não vejo menção ao Windows 7, por isso não tenho certeza do seu resultado final. Você está planejando para o Windows 7 para usar essas mesmas pastas? Isso seria um não ir como o Windows 7 usa um formato diferente para os perfis de usuário.
Isso também pode atrapalhar os Programas em Arquivos de Programas que são instalados de forma diferente, dependendo de você estar instalando o XP ou o Windows 7.