Marc está um pouco errado ... IDE, embora uma interface e uma tecnologia "antigas" não sejam exatamente "lentas".
Algumas placas-mãe ainda têm uma interface IDE, bem como todas as SATAs, eu sei que escolhi especificamente uma quando construí meu último PC (fui para o Asus P5Q) porque eu tinha algumas unidades PATA de 500g com dados ainda ativos. / p>
Desempenho, isso dependeria do que você está usando o sistema, se você planeja usar as 2 unidades IDE para armazenamento ou o significado do seu sistema operacional?
Qualquer aplicativo grande / de jogos - afaste-se do IDE / PATA para seu sistema operacional.
Apenas o trabalho geral do Office e da Web - você realmente não veria um grande impacto no desempenho.