% é o prompt de comando. Como > no DOS, que junto com o diretório de trabalho atual pode aparecer como C:\> .
Você pode realmente alterar isso para ser qualquer coisa que você gosta, mas % é o padrão para uma conta de usuário regular no shell csh ou zsh. O shell é o programa que exibe a linha de comando, lê o que você digita e executa o comando. Os sh sh ou bash shells usam $ para seus prompts de comando.
Se você estiver logado como root (a conta administrativa ou de superusuário), a maioria dos shells altera o caractere de prompt para # , para lembrá-lo de que é melhor ter cuidado com o que digitar.
Então, quando você vê % foobar na documentação, isso significa apenas abrir uma janela de terminal, digitar foobar e apertar enter.