Se você estiver usando o BitLocker, há um hotfix para esse problema.
Consulte este artigo:
Um computador pára de responder durante o desligamento se o BitLocker estiver habilitado na unidade do sistema em um computador que está em execução Windows 7 ou Windows Server 2008 R2
Outra possibilidade do Windows 7 Beta: problema de desligamento
Device Manager, select "IEEE 1394 Bus Host Controllers" group, only contains one device called "VIA 1394 OHCI Compilant Host COntroller" on that click right mouse button and select "Properties", select "Power Management" tab, and finally check the "Allow the computer to turn off this device to save power" box.
Em qualquer caso, mesmo que você não tenha esse dispositivo, teste melhor para que todos os dispositivos possíveis tenham essa política de energia ativada.