Isso pode ser migrado para o superusuário ... mas eu tive um problema parecido com isso. Vá para o sistema, preferências, aparência e efeitos visuais e desligue-os. Veja se a estabilidade melhora.
Você está descrevendo o que soa como o gerenciador de janelas falhando.
Em caso afirmativo, você pode aumentar certos efeitos e ver se determinados recursos do Compiz estão causando problemas. Há um gerenciador de compiz que pode ativar e desativar seletivamente os recursos conforme necessário e personalizar os efeitos.
Faça uma pesquisa no Google pelo fabricante da sua placa de vídeo e "compiz". Você também pode querer considerar fazer um backup do seu sistema, em seguida, atualizando para 9.10 ... várias falhas de driver foram corrigidas com versões posteriores.
(as instruções para efeitos visuais vêm de 9.10 ... você pode precisar procurar no google por "efeitos visuais compiz 8.10" para encontrar uma maneira de desativar o compiz. Você perderá todo o visual, mas para versões mais antigas e certas placas de vídeo, descobri que aumentou a estabilidade drasticamente, e versões posteriores pareceram limpá-las.)