Veja o Passo 2 neste guia de atualização da Microsoft:
When you upgrade to Windows 7, you keep your files, settings, and programs from Windows Vista.
Existem algumas condições (por exemplo):
Be sure your computer is running either Service Pack 1 or Service Pack 2 for Windows Vista. For more information, see the Windows Vista service packs webpage on the Microsoft website.
Eu também me certificaria de que todos os meus dados foram copiados primeiro também.