Existe uma infinidade de maneiras pelas quais os sites podem detectar sua versão em flash.
A Adobe mantém um "kit de detecção de flash" exatamente para esse fim.
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Script do lado do cliente. Usa JavaScript para verificar o plug-in do Netscape ou o controle ActiveX. Substitua o Javascript do site por seu próprio para falsificar isso.
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Detecção baseada em ActionScript. Usa um arquivo SWF para relatar a versão do flash.
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Detecção do lado do servidor. A aplicação do lado do servidor (ColdFusion, PHP, etc) determina a versão do flash usando informações do tipo mime no cabeçalho HTTP_ACCEPT. A edição desse cabeçalho falsificaria esse método.