Honestamente, se o seu sistema está funcionando o suficiente para interferir no seu trabalho - e estou assumindo aqui que "reportar bugs fantasmas" é uma interferência - está muito próximo da sua resolução final.
Reinstale o Windows.
Eu poderia dar outro dia ou dois ou cinco de pesquisa, mas definir um prazo. Se você ainda não encontrou uma solução, faça backup dos dados, formate a unidade, reinstale o sistema operacional, reinstale e reconfigure seus aplicativos e restaure seus dados. Se este for um laptop de trabalho, sua equipe de TI poderá aplicar uma imagem do sistema operacional limpa e você poderá ir a partir daí.
Se não for um laptop de trabalho e você não quiser arriscar a reinstalação de um sistema operacional em seu computador pessoal, é hora de convencer seu chefe a comprar um laptop de trabalho.