Eu já passei por esse processo e existem algumas dicas (que você encontrará se encontrar problemas semelhantes ao Google).
Detalhes aqui: link
Mas, em resumo:
Você só pode formatar as unidades anexando-as diretamente a um Mac (ou PC, se necessário). Não é possível formatar uma unidade conectada ao Airport Extreme.
Portanto, conecte cada unidade ao Mac e formate-a no HFS + (Mac OS X Extended Journaled). Certifique-se de definir o esquema de partição para GUID, bem como formate a partição para HFS +.
Eles são definidos separadamente e é possível ter uma unidade particionada como Master Boot Record (provavelmente o padrão de fábrica) e a partição formatada como HFS + (ou FAT32, o formato padrão de fábrica provável). Neste caso, o Mac irá lê-las e elas parecerão boas quando conectadas via USB, mas o AE não conseguirá reconhecê-las, acender a luz indicadora em laranja e informar "O disco precisa de reparo". Isso é verdade mesmo se houver apenas uma partição na unidade.
(O Airport Extreme não suporta NTFS, mas você está usando Macs, então isso não deve ser um problema).
De lá, conecte-os ao divisor USB e conecte o divisor ao Airport Extreme. Eles devem agora ser visíveis através do localizador.
Para fazer backup através do Time Machine, basta abrir as preferências do Time Machine (por meio das Preferências do Sistema ou do ícone do Time Machine na barra na parte superior), especifique a unidade e será bom.
O primeiro backup levará muito tempo, por isso é melhor conectar sua máquina diretamente ao Airport Express usando um cabo de rede. Mesmo com este backup 100Gb pode demorar 10 horas.
Um erro comum é fazer o primeiro backup conectando o disco rígido diretamente ao Mac via USB. Isso não funciona - o Time Machine não reconhecerá esse arquivo de backup quando estiver conectado via Airport Express - você precisa conectar o drive ao Airport Express via USB / Firewire e conectar o Mac ao Airport Extreme usando um cabo de rede.
Mas geralmente funciona bem, eu faço isso há mais de um ano sem problemas.