Você tem um mal-entendido - o SSD usa seu próprio tamanho de página para o TRIM, que é geralmente 4-16KB e é definido no seu firmware. Isso não tem nada a ver com o Windows.
Os melhores resultados são obtidos quando o disco é formatado com o mesmo tamanho de bloco, quando o sistema operacional e o SSD concordarem totalmente com o mesmo tamanho de página / bloco.
O Windows grava blocos inteiros, o SSD grava páginas inteiras, então, dados demais serão gravados se os tamanhos não forem iguais.
Além disso, tanto o firmware SSD quanto o driver de disco do sistema operacional otimizar algoritmos, que pode entrar em conflito quando os tamanhos não são iguais.