Acabei de criar uma configuração semelhante no meu Mac Mini (OS X Mavericks e Windows 7 no SSD interno, Ubuntu no disco externo). Veja o que você precisa fazer:
- crie imagens de backup da partição do OS X e do Windows (opcional, mas altamente recomendável)
- crie um pendrive inicializável com o instalador do ubuntu
- pressionando a tecla de opção, inicialize a partir do instalador do ubuntu
- instale o ubuntu no disco rígido externo
- Na reinicialização (tive que forçar o desligamento pressionando e mantendo pressionado o botão liga / desliga, pois parecia ter parado algum tempo depois de clicar em reinicializar), mantenha pressionada a tecla de opção para inicializar no OS X
- faça o download e instale o Gerenciador de inicialização Refind
- edite o arquivo de configuração de refindagem /efi/refind/refind.conf (a linha que você está procurando começa com scanfor) e verifique se o hdbios está incluído na lista
- na reinicialização, agora você deve ser saudado com um menu contendo um logotipo Ubuntu, Mac e Windows (você pode pressionar esc para atualizar a lista, pois as unidades externas podem levar algum tempo para serem exibidas; você pode configurar refind para pausar befaure mostrando o menu hte)
Espero que isso ajude.
Greg.