Sua falha é usar um valor fixo para arg3. For /R
irá iterar as pastas (sub) a partir de arg1 aplicando "jquery.js" para cada pasta, não avalia.
@Echo off
echo %1 %2 %3
for /r "%~1" %%g in ("%~3*") do echo %%~fg
Deve retornar:
C:\Batch Examples\TestDir02\jquery.js
C:\Batch Examples\TestDir04\jquery.js